Modesto Orozco: "La simulació és el nou microscopi molecular"

“Crec que el premi Nobel d’enguany és un reconeixement a tot un camp de recerca que ajuda a entendre com funciona la vida al nivell molecular i està revolucionant la visió que tenim dels éssers vius”, explica Modesto Orozco, especialista en modelització i bioinformàtica de l’Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona). Orozco és una de les autoritats internacionals en biosimulació a escala molecular i juntament amb Charles A. Laughton, de la Universitat de Nottingham, ha citat a Barcelona als abanderats del camp per discutir les recerques actuals. Serà durant el 4, 5 i 6 de novembre, en la XXII Conferència Barcelona Biomed, el programa de conferències científiques de l’IRB Barcelona, que aglutina a 150 especialistes en una atmosfera de “think tank”, i que estan finançades per la Fundació BBVA. Les reunions se celebren a l’Institut d’Estudis Catalans.

Experts de Nobel

El treball dels convidats troba les seves arrels en el dels premis Nobel, Martin Karplus, Arieh Warshel i Michael Levitt. Jiali Gao, de la Universitat de Minnesota, va treballar amb Martin Karplus a Harvard, essent un dels seus investigadors postdoctorals més notables i una de les persones que apareixen a la “Nobel Citation”. Gao és avui un científic reconegut mundialment per les seves contribucions teòriques a la simulació de les catàlisis enzimàtiques. L’italià Michele Parrinello, de l’Institut Tecnològic de Zurich, a Suïssa, és el científic que més ha contribuït, segons Orozco, a desenvolupar la dinàmica molecular, la simulació computacional dels moviments físics d’àtoms i molècules. El mètode “Car-Parrinello Molecular Dynamics (CP/MD)” és un dels més usats per estudiar el comportament de nous materials o la reactivitat enzimàtica. Parrinello figura entre els científics més citats del món i la seva contribució al camp apareix també a la “Nobel Citation”.

Helmuth Grubmuller, Erik Lindahl, Mark Samson, Gerhard Hummer, Richard Lavery, Adrian Muholan, F. Javier Luque i fins els vint experts convidats treballen en el desenvolupament de codis, algoritmes i eines de simulació molecular en una àrea comuna on convergeixen experts en química i biologia computacional, biologia estructural, biofísica i bioinformàtica i empenyen el desenvolupament de la dinàmica molecular per a la simulació de sistemes biològics.

“La supercomputació aplicada a la biologia ens està donant la capacitat d’entendre com funcionen els sistemes biològics, de comprendre, per exemple, com són, com es mouen i com interaccionen les proteïnes, nano-màquines que estan en constant moviment”, diu Orozco. “Això ha tingut un impacte molt gran en la indústria farmacèutica perquè permet abordar el disseny racional de fàrmacs, substituint el mètode tradicional de sintetitzar desenes de milers de compostos guiats per l’atzar o la intuïció”. Segons l’investigador de l’IRB, catedràtic de la UB, que també dirigeix el programa conjunt de recerca en biologia computacional de l’IRB i el Barcelona Supercomputing Center (BSC), “existeixen molt pocs fàrmacs avui que abans d’arribar al mercat no hagin passat primer per aquest tipus de proves de simulació”.

22ena Conferència Barcelona Biomed:

Frontiers In Dynamics Simulations Of Biological Molecules

Les Conferències Barcelona Biomed

Les Conferències Barcelona BioMed són una iniciativa de l’IRB Barcelona i la Fundació BBVA. És el programa de reunions científiques internacionals de l’IRB Barcelona on es discuteixen temes prioritaris en l’àmbit de la biomedicina. Al llarg de dos dies i mig, es reuneixen prestigiosos científics de tot el món experts en la temàtica sotmesa a debat en una atmosfera de think tank. Les Conferències també serveixen de plataforma per projectar la recerca d’excel·lència desenvolupada a centres catalans i espanyols cap a l’exterior. Estan organitzades per un cap de grup de l’IRB Barcelona conjuntament amb un científic d’un altre centre internacional de prestigi en l’àrea a debatre. La sèrie es va instaurar la tardor de 2006.