Salvatella: "Para obtener mejores fármacos debemos de utilizar la información sobre el movimiento de las proteínas"

Las proteínas –las obreras de las células- son estructures tridimensionals flexibles que llevan a cabo su función ligada a pequeñas y variadas modificaciones de su forma. Conocer todos los movimients es fundamental para diseñar fármacos que se engachen de forma óptima. Hoy, investigadores de todo el mundo están poniendo a punto técnicas revolucionarias que permiten imaginar un futuro prometedor para los expertos que diseñan nuevas moléculas terapéuticas. Del 24 al 26 de octubre los mejores científicos internacionales en dinámica de proteínas se reunirán en Barcelona invitados por el Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona) y la Fundación BBVA en el marco de la Conferencia Barcelona BioMed “Macromolecular Dynamics”. Xavier Salvatella, investigador ICREA en el IRB Barcelona y coorganizador de la reunión explica que “el campo de la dinámica de macromoléculas ya está lo suficiente madura como para que investigadores de los Estados Unidos hayan creado una empresa que explotará la dinámica para diseñar medicamentos”. El pionero ha sido el científico de la Universidad de Michigan, Hashim Al-Hashimi, uno de los 20 eruditos invitados.

Los expertos coinciden en que el reto es pasar de una información estática de proteínas a una inforamción dinámica. Hay diversas formas de obtener esta información y una de las más importantes es la simulación computacional. El biofísico Modesto Orozco, científico del IRB Barcelona y director del programa de Ciencias de la Vida del Barcelona Supercomputing Center, está construyendo la base de datos más grande del mundo que inclue el movimiento de unas dos mil proteínas, “el 30% de las cuales son proteínas humanas que son diana potencial de un nuevo fármaco”, explica Orozco. Esto lo están haciendo con la ayuda del MareNostrum, uno de los superordenadores más potentes del mundo para predecir trayectorias. Pero las simulaciones necesitan ser validadas con experimentos en el laboratorio. “El congreso explotará la interconnexión entre estas dos corrientes: los experimentalistas y los simuladores computacionales, con espacio también para los investigadores híbridos”, resume Salvatella.

Capturar el movimiento de una cèl·lula

El futuro en dinámica de macromoléculas apunta hacia un reto mayúsculo todavía para las técnicas disponibles. “Lo ideal sería poder simular no sólo el comportamiento de una única proteína sino de toda una unidad biológica y poder confirmar los cálculos con técnicas experimentales”, propone Salvatella. “Estamos refinando las técnicas experimentales, cada dia que pasa aumenta la rapidez de cálculo de los ordenadores y ya se han construido supercomputadores especializados únicamente en simulaciones biológicas. Pero la dinámica de moléculas de hoy ya está aportando una gran cantidad de información que nos permite comprender más detalladamente procesos biológicos complejos”, concluye.

Más información sobre la conferencia y los ponentes participantes

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