Images
Participants
Contact
La combinació de dos forts desnaturalitzants d'ADN condueix a l'estabilització de l'estructura.
És una troballa inesperada que obre nous camps en l'ús biotecnològic de l'ADN
La piridina, coneguda per desplegar l'ADN, també pot tenir un fort efecte estabilitzant sota condicions àcides. Un estudi basat en experiments de laboratori i computacionals destaca la naturalesa canviable de la piridina com desnaturalitzant i obre noves perspectives per alterar l'estabilitat tèrmica dels àcids nucleics. Els resultats d'aquest estudi estan disponibles ja a Angewandte Chemie, una de les principals revistes de química.
El document es basa en evidències experimentals i teòriques que segons les condicions de pH la piridina promou canvis dràstics en l'ADN. Mentre que a pH neutre, la piridina redueix l'estabilitat del dúplex d'ADN, fins i tot a baixa concentració, a pH àcid es produeix el contrari.
Implicacions biotecnològiques
Els resultats permeten abordar estudis futurs sobre la relació entre la piridina i els seus derivats amb l'ADN amb implicacions biotecnològiques clares. L'origen estructural de l'estabilització de piridina positiva podria explotar-se en experiments en què l'ADN s'hagi de mantenir estable mentre que altres macromolècules es despleguen, i dissenyar nous derivats de piridina catiònics per a la transferència de gens que han d'actuar en un medi àcid.
A més, la manera similar d'interacció detectat entre el nutrient colina i cations de piridina positiva amb l'ADN suggereix una via per al disseny de nous agents d'ADN per a aplicacions nano biotecnològiques (com ara nano dispositius amb aplicacions en fotònica, litografia i electrònica), i l’efecte canviant de la piridina pot ajudar al desenvolupament de nanoconmutadors programables basats amb ADN, com nanosensors capaços de respondre als canvis de pH del seu entorn.
Autors
L'estudi ha estat dirigit per Guillem Portella, Montserrat Terrazas i liderat per Modesto Orozco, tots ells del Programa Conjunt BSC - IRB Barcelona en Biologia Computacional, i en col·laboració amb la Universitat de Barcelona, la Universitat de Cambridge i el CSIC.
Article de referència:
Can A Denaturant Stabilize DNA? Pyridine Reverses DNA Denaturation in Acidic pH
Guillem Portella, Montserrat Terrazas, Núria Villegas, Carlos González and Modesto Orozco
Angewandte Chemie (July 2015) DOI: 10.1002/anie.201503770
IRB Barcelona
L’Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona) treballa per aconseguir una vida lliure de malalties. Desenvolupa una recerca multidisciplinària d’excel·lència per curar el càncer i altres malalties vinculades a l'envelliment. Treballa establint col·laboracions amb la indústria farmacèutica i els principals hospitals per fer arribar els resultats de la recerca a la societat a través de la transferència de tecnologia, i du a terme diferents iniciatives de divulgació científica per mantenir un diàleg obert amb la ciutadania. L’IRB Barcelona és un centre internacional que acull al voltant de 400 investigadors de més de 30 nacionalitats. Reconegut com a Centre d'Excel·lència Severo Ochoa des de 2011, és un centre CERCA i membre del Barcelona Institute of Science and Technology (BIST).