Científics espanyols seqüencien el genoma de la leucèmia limfàtica crònica

Un equip de científics nacionals, entre els quals hi ha els investigadors de l'IRB Barcelona Modesto Orozco i Josep L. Gelpí, del Programa Conjunt d'Investigació en Biologia Computacional amb el Barcelona Supercomputing Center (BSC), ha seqüenciat els genomes de cèl·lules normals i tumorals de pacients amb leucèmia limfàtica crònica. Entre les conclusions de l'estudi destaca que aquests tumors presenten mil mutacions en el genoma. Concretament, han identificat quatre gens com a responsables del desenvolupament d'aquest tipus de leucèmia. En aquest treball, que es publica avui a la revista Nature, han col·laborat més de 60 investigadors del Consorci Espanyol del Genoma de la Leucèmia Limfàtica Crònica (CLL Genome) i ha representat un esforç humà i tècnic extraordinari. "Només les dades dipositades en el BSC representen més de 20 Terabytes, l’equivalent a més de 200 discs durs d’ordinadors personals", assenyala Orozco.

La leucèmia limfàtica crònica és la leucèmia més freqüent en els països occidentals, amb més de mil nous pacients diagnosticats cada any al nostre país. Gràcies als avenços en el coneixement de la biologia molecular del càncer durant les últimes dècades se sap que és causada per l'acumulació de danys genètics que provoquen una proliferació incontrolada dels limfòcits B. No obstant això, es desconeixia quines mutacions provocaven aquesta divisió cel·lular sense control.

En aquest treball, els investigadors han fet servir la més avançada tecnologia per seqüenciar els 3.000 milions de nucleòtids del genoma de cèl·lules tumorals provinents de quatre pacients, i l'han comparat amb la seqüència del genoma de les cèl·lules sanes d’aquests individus. "Aquesta aproximació ens ha permès comprovar que cada tumor conté unes mil mutacions en el seu genoma" comenta el Dr López-Otín, un dels directors del treball. "El posterior anàlisi dels gens mutats d’un grup de més de 300 pacients va permetre identificar mutacions en quatre gens que provoquen el desenvolupament d’aquest tipus de leucèmia".

Els importants avenços d’aquest l'estudi, derivats de l'anàlisi exhaustiu dels quatre primers genomes de pacients amb leucèmia limfàtica crònica, han permès el descobriment de nous mecanismes implicats en el desenvolupament d’aquesta malaltia. El treball dels investigadors espanyols confirma la utilitat de la seqüenciació massiva de genomes per conèixer les causes genètiques del càncer.

Actualment un total de 38 projectes han iniciat l’estudi de 17.000 genomes tumorals. L'objectiu de CLL Genome per als propers anys és ampliar aquest treball a la seqüenciació i l’anàlisi de 500 genomes tumorals de 50 tipus diferents de càncer (25.000 genomes tumorals).

Les institucions que han participat en aquest estudi són: el Hospital Clínic de Barcelona; el Instituto Universitario de Oncología de la Universidad de Oviedo; la Universitat de Barcelona; l’Institut d’Investigacions Biomèdicas August Pi i Sunyer; el Centro de Regulación Genómica de Barcelona; la Fundació Institut d’Investigació Biomèdica de Bellvitge-Institut Català d’Oncología; el Hospital Universitario y Centro de Investigación del Cáncer de Salamanca; el Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas; la Universidad de Deusto; la Universidad de Santiago de Compostela; el Barcelona Supercomputing Center–Centro Nacional de Supercomputación; el Centro Nacional de Análisis Genómico; i  l’IRB Barcelona. També ha comptat amb la col.laboració del Wellcome Trust Sanger Institute en Hinxton, Regne Unit.

Article de referència:
Whole-Genome Sequencing Identifies Recurrent Mutations in Chronic Lymphocytic Leukaemia.
Nature (2011) [doi:10.1038/nature10113]