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Describen un nuevo método que permite el análisis de la expresión génica de células poco abundantes en los organismos.
Científicos del IRB Barcelona desarrollan un nuevo método, denominado “Pico Profiling”, que permite por primera vez un análisis de la actividad génica fiable y completo a partir de muestras que contienen un pequeño número de células. El trabajo, liderado por Herbert Auer, jefe de la Plataforma Científica de Genómica Funcional del IRB Barcelona, y que ha contado con la colaboración de investigadores del laboratorio MetLab del IRB Barcelona y de la Ohio State University, permitirá el estudio en profundidad de aquellas células difíciles de obtener debido a su escasa abundancia en el organismo. El artículo se ha publicado en PLoS ONE, revista internacional que trata de las disciplinas relacionadas con la ciencia y la medicina.
Todas las células funcionan siguiendo la información contenida en los genes, por lo que alteraciones en la actividad génica pueden desencadenar desórdenes graves en el funcionamiento celular e incluso ser causa de enfermedades. El análisis detallado de la actividad de los genes, a través de los perfiles de expresión génica, es una de las estrategias más completas para el estudio del funcionamiento de las células y su comportamiento durante el desarrollo de una enfermedad. Mientras que los métodos convencionales de análisis de expresión génica son eficaces para un gran número de poblaciones celulares, el hecho de que necesiten millones de células dificulta el estudio de aquellas poblaciones celulares poco frecuentes, como las células metastásicas, las células madre o las células embrionarias. “En el caso de las células madre hematopoyéticas (aquellas que forman las células de la sangre) de ratón, tendríamos que sacrificar cientos de animales para tener suficiente material para el análisis de expresión génica mediante los métodos convencionales” explica Auer.
En este trabajo los investigadores desarrollan un nuevo método de análisis de actividad génica que permite el estudio de tan solo 10 células e incluso células individuales, material un millón de veces menor al que necesitan los métodos convencionales. Este nuevo método, que introduce cambios en los procesos de obtención del material biológico y de su posterior multiplicación, ofrece resultados reproducibles y similares a los obtenidos mediante las técnicas convencionales, que utilizan un mayor número de células. “Anteriormente se habían descrito varias metodologías para el estudio de la expresión génica a partir de un número reducido de células, pero nosotros demostramos que la mitad de sus resultados no representa lo que realmente ocurre en la naturaleza”, dice Auer.
Un reto de la biomedicina actual es conseguir información fiable a partir de poblaciones celulares poco frecuentes. El trabajo de Auer ofrece por primera vez la posibilidad de estudiar de una forma exacta el comportamiento de algunas de estas células, como por ejemplo las células metastásicas, que son las responsables en el 90% de las muertes por cáncer.
Artículo de referencia:
Accurate expression profiling of very small cell populations
Eva Gonzalez-Roca, Xavier Garcia-Albéniz, Silvia Rodriguez-Mulero, Roger R. Gomis, Karl Kornacker, and Herbert Auer.
PLoS One (2010) [doi: 10.1371/journal.pone.0014418]
IRB Barcelona
El Instituto de Investigación Biomédica (IRB Barcelona) trabaja para conseguir una vida libre de enfermedades. Desarrolla una investigación multidisciplinar de excelencia para curar el cáncer y otras enfermedades vinculadas al envejecimiento. Establece colaboraciones con la industria farmacéutica y los principales hospitales para hacer llegar los resultados de la investigación a la sociedad, a través de la transferencia de tecnología, y realiza diferentes iniciativas de divulgación científica para mantener un diálogo abierto con la ciudadanía. El IRB Barcelona es un centro internacional que acoge alrededor de 400 científicos de más de 30 nacionalidades. Reconocido como Centro de Excelencia Severo Ochoa desde 2011, es un centro CERCA y miembro del Barcelona Institute of Science and Technology (BIST).