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- El proyecto MDDB cuenta con una financiación de 3,3 millones de euros y tiene una duración prevista de tres años.
- Además del IRB Barcelona, el proyecto cuenta con la colaboración del European Molecular Biology Laboratory, Barcelona Supercomputing Center, KTH Royal Institute of Technology y la biotech Nostrum Biodiscovery, the Swiss Federal Institute of Technology in Lausanne y la Universidad de Oxford.
- La reunión de inicio del proyecto se celebro el 24 y 25 de abril en Barcelona.
La simulación de dinámicas moleculares es un método computacional utilizado en biología para estudiar el comportamiento de moléculas y sistemas complejos. La información obtenida a partir de estas simulaciones puede ser utilizada para entender una amplia variedad de fenómenos, como la formación de proteínas, la interacción entre moléculas o la dinámica de las reacciones químicas. Es un campo de investigación emergente que está generando mucho conocimiento y, sin embargo, aun no existe una base de datos unificada que agrupe y almacene esos datos de manera accesible y sistematizada.
Investigadores encabezados por el Dr. Modesto Orozco, jefe del laboratorio de Modelización Molecular y Bioinformática del IRB Barcelona, han puesto en marcha un proyecto para diseñar la base de datos europea de dinámicas moleculares. Durante los próximos tres años los científicos sentarán las bases para la creación de una infraestructura que optimice los recursos computacionales, favorezca el análisis de datos desde distintas perspectivas, garantice un intercambio rápido y eficiente de información entre distintas instituciones; y facilite la integración de las dinámicas moleculares en otras áreas de investigación.
Los días 24 y 25 de abril se celebró en Barcelona la reunión inaugural del proyecto, a la que asistieron representantes de todas las instituciones que componen el consorcio: el Barcelona Supercomputing Center (BSC CNS), European Bioinformatics Institute del EMBL (EMBL-EBI), el KTH Royal Institute of Technology de Estocolmo (KTH), la spin-off Nostrum Biodiscovery, Centre Européen de Calcul Atomique et Moléculaire (CECAM) de la Swiss Federal Institute of Technology Lausanne (EPFL) y la Universidad de Oxford (UOXF), además del IRB Barcelona.
Esta reunión inaugural servirá para detallar el plan de acción para los próximos tres años, compartir conocimiento estratégico y definir acciones para involucrar a la comunidad científica experta en el campo de las dinámicas moleculares.
Con el fin de garantizar el desarrollo de una infraestructura estable a largo plazo, el consorcio MDDB reúne centros de datos y de computación de alto rendimiento, representantes de la comunidad de simulación de dinámica molecular y expertos en la gestión de datos y operación de bases de datos. KTH es el desarrollador de software más importante de Europa; IRB Barcelona, Nostrum Biodiscovery, el BSC-CNS, KTH, UOXF son grandes productores y usuarios de datos de dinámica molecular. IRB Barcelona, UOXF, Nostrum Biodiscovery y el BSC-CNS, además, fueron los desarrolladores de los primeros prototipos de bases de datos de dinámica molecular. EMBL-EBI aporta su amplia experiencia en el desarrollo y operación de bases de datos biológicos de referencia y CECAM-EPFL aglutina las diferentes comunidades facilitando el intercambio de información que permita desarrollar una base de datos que responda a las necesidades de los usuarios.
La creación de una base de datos de dinámica molecular podría tener un gran impacto en la investigación en áreas como la bioquímica, la farmacología, la medicina personalizada, la química o la nanotecnología. “El proyecto MDDB que lanzamos hoy es una prueba de concepto y esperamos que establezca los cimientos para que una futura infraestructura que reuna los resultados de simulación molecular y los integre en el ecosistema de datos que mueve la biología actual”, explica el Dr. Orozco, también catedrático del Departamento de Bioquímica y Biomedicina de la Universidad de Barcelona.
El proyecto cuenta con una financiación de 3,3 millones de euros, (de los cuales 2,6M€ obtenidos del programa Horizon Europe de la Comisión Europea, 0,35M€ aportados por la agencia inglesa UK Research and Innovation y 0,34M€ por la suiza State Secretariat for Education, Research and Innovation), tendrá una duración de tres años y espera conseguir el apoyo necesario para ser considerada una infraestructura estratégica en los planes nacionales y europeos.
Este proyecto ha recibido financiación del programa Horizon de la Unión Eurpea (grant agreement 101094651).
IRB Barcelona
El Instituto de Investigación Biomédica (IRB Barcelona) trabaja para conseguir una vida libre de enfermedades. Desarrolla una investigación multidisciplinar de excelencia para curar el cáncer y otras enfermedades vinculadas al envejecimiento. Establece colaboraciones con la industria farmacéutica y los principales hospitales para hacer llegar los resultados de la investigación a la sociedad, a través de la transferencia de tecnología, y realiza diferentes iniciativas de divulgación científica para mantener un diálogo abierto con la ciudadanía. El IRB Barcelona es un centro internacional que acoge alrededor de 400 científicos de más de 30 nacionalidades. Reconocido como Centro de Excelencia Severo Ochoa desde 2011, es un centro CERCA y miembro del Barcelona Institute of Science and Technology (BIST).
